Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms