Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms