Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms