Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms