Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp4A4UUI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp4A4UUI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms