Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms