Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms