Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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