Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3fA2ANE1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms