Protein–RNA interactions for Protein: A2AJX4

Malrd1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malrd1A2AJX4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Malrd1A2AJX4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malrd1A2AJX4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms