Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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