Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc183A2AJB1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms