Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VirmaA2AIV2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms