Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms