Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms