Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms