Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms