Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1744.6 ms