Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh22Q9WTP5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh22Q9WTP5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh22Q9WTP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh22Q9WTP5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh22Q9WTP5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh22Q9WTP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh22Q9WTP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms