Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim3Q9R1R2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim3Q9R1R2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim3Q9R1R2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim3Q9R1R2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim3Q9R1R2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim3Q9R1R2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim3Q9R1R2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms