Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ntn3Q9R1A3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ntn3Q9R1A3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ntn3Q9R1A3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ntn3Q9R1A3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ntn3Q9R1A3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ntn3Q9R1A3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms