Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrpxQ9R0M3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpxQ9R0M3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrpxQ9R0M3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrpxQ9R0M3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrpxQ9R0M3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms