Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf11Q9QYK7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf11Q9QYK7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf11Q9QYK7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf11Q9QYK7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf11Q9QYK7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf11Q9QYK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf11Q9QYK7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf11Q9QYK7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf11Q9QYK7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms