Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca3a1Q9QX15 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca3a1Q9QX15 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a1Q9QX15 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3a1Q9QX15 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms