Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pole3Q9JKP7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole3Q9JKP7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole3Q9JKP7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole3Q9JKP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole3Q9JKP7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms