Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Caln1Q9JJG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caln1Q9JJG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caln1Q9JJG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caln1Q9JJG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caln1Q9JJG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caln1Q9JJG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Caln1Q9JJG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Caln1Q9JJG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Caln1Q9JJG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caln1Q9JJG7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms