Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup50Q9JIH2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup50Q9JIH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup50Q9JIH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup50Q9JIH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup50Q9JIH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup50Q9JIH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup50Q9JIH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms