Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ms4a4bQ9ES61 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms