Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb3Q9ERD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubb3Q9ERD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb3Q9ERD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb3Q9ERD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb3Q9ERD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb3Q9ERD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb3Q9ERD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb3Q9ERD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms