Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr9Q9EQU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr9Q9EQU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tlr9Q9EQU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr9Q9EQU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr9Q9EQU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr9Q9EQU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tlr9Q9EQU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr9Q9EQU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms