Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne8Q9DC53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne8Q9DC53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpne8Q9DC53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne8Q9DC53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne8Q9DC53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne8Q9DC53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpne8Q9DC53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms