Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem43Q9DBS1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem43Q9DBS1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem43Q9DBS1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem43Q9DBS1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmem43Q9DBS1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem43Q9DBS1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms