Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cab39lQ9DB16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cab39lQ9DB16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cab39lQ9DB16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cab39lQ9DB16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cab39lQ9DB16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39lQ9DB16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms