Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmd12Q9D8W5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd12Q9D8W5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd12Q9D8W5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd12Q9D8W5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psmd12Q9D8W5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmd12Q9D8W5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms