Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hm13Q9D8V0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hm13Q9D8V0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hm13Q9D8V0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hm13Q9D8V0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms