Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgap3Q9D8S3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgap3Q9D8S3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgap3Q9D8S3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgap3Q9D8S3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap3Q9D8S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap3Q9D8S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Arfgap3Q9D8S3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap3Q9D8S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgap3Q9D8S3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms