Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn23Q9D7D7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn23Q9D7D7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn23Q9D7D7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn23Q9D7D7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms