Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Exosc8Q9D753 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exosc8Q9D753 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exosc8Q9D753 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Exosc8Q9D753 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Exosc8Q9D753 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exosc8Q9D753 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exosc8Q9D753 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms