Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
4933428G20RikQ9D3X4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
4933428G20RikQ9D3X4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms