Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Snapc3Q9D2C9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Snapc3Q9D2C9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Snapc3Q9D2C9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Snapc3Q9D2C9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Snapc3Q9D2C9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snapc3Q9D2C9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Snapc3Q9D2C9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snapc3Q9D2C9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Snapc3Q9D2C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snapc3Q9D2C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Snapc3Q9D2C9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snapc3Q9D2C9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Snapc3Q9D2C9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Snapc3Q9D2C9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Snapc3Q9D2C9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Snapc3Q9D2C9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snapc3Q9D2C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Snapc3Q9D2C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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