Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc6bQ9D289 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc6bQ9D289 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc6bQ9D289 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trappc6bQ9D289 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms