Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Necap2Q9D1J1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Necap2Q9D1J1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Necap2Q9D1J1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Necap2Q9D1J1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Necap2Q9D1J1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Necap2Q9D1J1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms