Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndc80Q9D0F1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndc80Q9D0F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndc80Q9D0F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndc80Q9D0F1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc80Q9D0F1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndc80Q9D0F1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms