Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mid1ip1Q9CQ20 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mid1ip1Q9CQ20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid1ip1Q9CQ20 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1ip1Q9CQ20 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms