Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnaseh2cQ9CQ18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnaseh2cQ9CQ18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms