Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkd1Q99MH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkd1Q99MH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkd1Q99MH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkd1Q99MH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkd1Q99MH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkd1Q99MH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkd1Q99MH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkd1Q99MH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms