Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmp1Q99KU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmp1Q99KU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vmp1Q99KU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmp1Q99KU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmp1Q99KU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms