Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf19Q99KJ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf19Q99KJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf19Q99KJ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf19Q99KJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf19Q99KJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcf19Q99KJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf19Q99KJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf19Q99KJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf19Q99KJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms