Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdxdc1Q99K01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdxdc1Q99K01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdxdc1Q99K01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdxdc1Q99K01 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdxdc1Q99K01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdxdc1Q99K01 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdxdc1Q99K01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdxdc1Q99K01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdxdc1Q99K01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdxdc1Q99K01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms