Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf2Q921K8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf2Q921K8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf2Q921K8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcaf2Q921K8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcaf2Q921K8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcaf2Q921K8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms